江西农业大学在家猪基因组学研究领域取得重要原创性成果

2015年1月26日，江西农业大学猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室主持完成的研究论文《全基因组重测序揭示猪环境适应性的分子机理及可能的属间杂交现象》（Adaptation and possible ancient interspecies introgression in pigs identified by whole-genome sequencing）以全文（Article）形式在线发表于国际顶级学术期刊《自然-遗传》（Nature Genetics）。

　　

　　该研究由江西农业大学主导，在国家重大科技专项、国家自然科学基金重点项目和教育部长江学者创新团队项目的资助下，联合深圳华大基因及美国加州大学伯克利分校共同完成。江西农业大学是该论文的唯一通讯作者单位，黄路生院士和任军教授为论文的共同通讯作者，江西农业大学艾华水博士、杨斌博士和深圳华大基因的方晓东博士为论文的共同第一作者。

　　

　　《自然-遗传》创刊于1993年，是国际遗传学研究领域顶级学术刊物。据悉，该文是在国际上首次采用新一代测序技术对家猪开展了深度（25X）基因组重测序分析，是我国猪遗传育种领域第二篇发表于《自然-遗传》的论文，也是我省首篇本土完成、发表于国际顶级学术期刊的论文，实现了我国动物遗传育种和我省自然科学研究的重要突破。

　　

　　中国是世界第一养猪生产大国，2014年生猪出栏7.35亿头，占全球总量的一半。中国也是全球家猪的两个主要驯化中心之一，拥有全球最丰富的地方猪种资源，品种数量占全球总量的1/3。经过近万年的自然选择和人工选育，中国地方猪种形成了繁殖力高、肉质鲜美、抗逆性强等优异种质特性，并对中国南北方不同的生态环境产生了极佳的适应性。然而，导致这种环境适应性的分子机理并不为人所知。

　　

　　江西农业大学猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室历时4年半，成功构建了覆盖我国24个省市自治区现有的68个猪种的中国地方猪种基因组DNA库。在此基础上，挑选出来自我国15个不同地理居群的、代表广泛血缘的32个猪种69头无相关血缘中国地方猪；与深圳华大科技的研究人员一起，针对这69头猪进行了全基因组高覆盖度（25X）的重测序，由此鉴别了4100万个基因组变异位点，其中52%为新发现的位点，达2100万个；这些发现极大地丰富了国际猪基因组遗传变异位点数据库，为全球特别是中国地方猪种质特性遗传机制研究和优良基因资源挖掘提供了重要基础性科学数据。